内设机构和直属支队：

办公室、政策研究室、档案处、综合处、人事处、宣传处、教育训练处、离退休干部工作处、审计处、装备财务处、警务保障处、信访处、直属机关党委、特警（防暴）支队、交通管理局（公路巡逻警察支队）、治安管理支队（巡警支队）、刑事侦查支队、水上分局（水上巡逻警察支队）、警务督察支队、直属机动支队（食品药品与环境犯罪侦查支队）、经济犯罪侦查支队、监所管理支队、出入境管理支队、法制支队、科技信息化支队、政务服务支队、直属一支队、直属二支队、直属三支队等机构。

派出机构：东湖分局、西湖分局、青云谱分局、青山湖分局、经济技术开发区分局、红谷滩分局、高新技术开发区分局、湾里分局、新建分局、地铁分局、森林分局。

根据中发[1999]6号文件精神，保留政治部，工会、团委、妇委会按章程设置。另设有南昌市人民警察学校、南昌市公安局后勤服务中心（已撤销）2个事业单位正在改革调整当中，原下属2个企业（保安服务总公司和洪安服务总公司）正在改制，下辖南昌县、进贤县、安义县3个县公安局。